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2019 कोरोनावायरस रोग (COVID-19) के प्रकोप के बाद से, दुनिया भर में कई वाणिज्यिक न्यूक्लिक एसिड प्रवर्धन परीक्षण (NAAT) विकसित किए गए हैं और मानक परख बन गए हैं। हालाँकि कई परीक्षण जल्दी से विकसित किए गए और प्रयोगशाला नैदानिक परीक्षणों में लागू किए गए, इन परीक्षणों के प्रदर्शन का मूल्यांकन विभिन्न सेटिंग्स में नहीं किया गया है। इसलिए, इस अध्ययन का उद्देश्य समग्र संदर्भ मानक (CRS) का उपयोग करके एबॉट SARS-CoV-2, डान जीन, BGI और सैनसुरे बायोटेक परख के प्रदर्शन का मूल्यांकन करना था। यह अध्ययन 1 से 30 दिसंबर 2020 तक इथियोपियन पब्लिक हेल्थ इंस्टीट्यूट (EPHI) में किया गया था। QIAamp RNA मिनी किट और एबॉट DNA नमूना तैयारी प्रणाली का उपयोग करके 164 नासॉफिरिन्जियल नमूने निकाले गए। 164 नमूनों में से, 59.1% सकारात्मक थे और 40.9% CRS के लिए नकारात्मक थे। सैनसुरे बायोटेक की सकारात्मकता सीआरएस की तुलना में काफी कम थी (पी < 0.05)। सैनसुरे बायोटेक की सकारात्मकता सीआरएस की तुलना में काफी कम थी (पी < 0.05)। Положительные результаты Sansure Biotech были значительно ниже по сравнению с CRS (p) <0,05). सैनसुरे बायोटेक के सकारात्मक परिणाम सीआरएस की तुलना में काफी कम थे (पी < 0.05)।सीआरएस स्रोत, सैन्स्योर बायोटेक डेटा स्रोत (p < 0.05)सीआरएस स्रोत, सैन्स्योर बायोटेक डेटा स्रोत (p < 0.05) सैन्स्योर बायोटेक के पास एक बड़ा मोबाइल फोन है सीआरएस (पी <0,05)। सीआरएस की तुलना में सैनसुरे बायोटेक के सकारात्मक परिणाम काफी कम थे (पी < 0.05)।सीआरएस की तुलना में चारों विश्लेषणों की समग्र सहमति 96.3-100% थी। सैनसुरे बायोटेक परख की कम सकारात्मकता दर के अलावा, चारों परखों का प्रदर्शन लगभग तुलनीय था। इस प्रकार, सैनसुरे बायोटेक [रिसर्च ओनली (RUO)] परख को इथियोपिया में इसके उपयोग के लिए अतिरिक्त सत्यापन की आवश्यकता है। अंत में, उचित निर्माता के दावों के साथ परख का मूल्यांकन करने के लिए अतिरिक्त शोध पर विचार किया जाना चाहिए।
प्रयोगशाला परीक्षण विश्व स्वास्थ्य संगठन (WHO) की कोरोनावायरस रोग 2019 (COVID-19) तैयारी और प्रतिक्रिया (SPRP) के लिए रणनीतिक योजना का हिस्सा है। WHO ने सलाह दी है कि देशों को तैयारियों, उचित केस प्रबंधन, सतर्कता और सार्वजनिक स्वास्थ्य चुनौतियों के लिए त्वरित प्रतिक्रिया में सुधार करने के लिए प्रयोगशाला क्षमता का निर्माण करने की आवश्यकता है। इससे पता चलता है कि प्रयोगशाला की भूमिका रोग और उभरते संक्रामक एजेंटों की महामारी विज्ञान को चिह्नित करने और उनके प्रसार को नियंत्रित करने के लिए महत्वपूर्ण है।
कोविड-19 के निदान के लिए महामारी विज्ञान और चिकित्सा संबंधी जानकारी, व्यक्तिगत लक्षण/संकेत, तथा रेडियोग्राफिक और प्रयोगशाला डेटा2 की आवश्यकता होती है। चीन के वुहान में कोविड-19 के प्रकोप की सूचना मिलने के बाद से, दुनिया भर में कई वाणिज्यिक न्यूक्लिक एसिड प्रवर्धन परीक्षण (NAAT) विकसित किए गए हैं। गंभीर तीव्र श्वसन सिंड्रोम 2 (SARS-CoV-2)3 संक्रमण के प्रयोगशाला निदान के लिए नियमित और मानक विधि के रूप में रीयल-टाइम रिवर्स ट्रांसक्रिप्शन पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन (rRT-PCR) का उपयोग किया गया है। SARS-CoV-2 का आणविक पता लगाना आम तौर पर वायरल जीनोम से पहचाने गए ORF1a/b (ओपन रीडिंग फ्रेम 1a/b) जीन) क्षेत्र में N (न्यूक्लियोकैप्सिड प्रोटीन जीन), E (एनवेलप प्रोटीन जीन) और RdRp (RNA-निर्भर RNA पॉलीमरेज़ जीन) जीन पर आधारित होता है। इन्हें वायरस पहचान के लिए वायरल जीनोम में पाए जाने वाले मुख्य संरक्षित क्षेत्र माना जाता है4। इन जीनों में, RdRp और E जीन में उच्च विश्लेषणात्मक पहचान संवेदनशीलता होती है, जबकि N जीन में कम विश्लेषणात्मक संवेदनशीलता होती है5।
पीसीआर परीक्षणों का प्रदर्शन विभिन्न कारकों के आधार पर भिन्न हो सकता है जैसे: निष्कर्षण अभिकर्मक, प्रवर्धन/पहचान अभिकर्मक, निष्कर्षण विधि, पीसीआर मशीन की गुणवत्ता और अन्य उपकरण। अप्रैल 2020 तक, नौ देशों के 48 से अधिक विभिन्न नैदानिक उपकरणों को कोविड-196 निदान के लिए आपातकालीन उपयोग प्राधिकरण (ईयूए) प्राप्त हुआ है। इथियोपिया में, 26 सार्वजनिक स्वास्थ्य संस्थानों में SARS-CoV-2 के पीसीआर पता लगाने के लिए 14 से अधिक रियल-टाइम पीसीआर प्लेटफ़ॉर्म का उपयोग किया जाता है, जिसमें ABI 7500, Abbott m2000, Roche 48000 और Quant-studio7 शामिल हैं। इसके अलावा, विभिन्न पीसीआर टेस्ट किट उपलब्ध हैं, जैसे कि दान जीन टेस्ट, एबॉट SARS-CoV-2 टेस्ट, सैनसुरे बायोटेक टेस्ट और SARS-CoV-2 BGI टेस्ट। हालांकि आरआरटी-पीसीआर अत्यधिक संवेदनशील है, लेकिन कोविड-19 के कुछ रोगी अनुचित संग्रह, परिवहन, भंडारण और हैंडलिंग और प्रयोगशाला परीक्षण के कारण नमूनों में वायरल राइबोन्यूक्लिक एसिड (आरएनए) की अपर्याप्त प्रतियों के कारण गलत नकारात्मक परिणाम रिपोर्ट करते हैं। कर्मियों की स्थितियां और क्रियाएं8। इसके अलावा, नमूना या नियंत्रण गलत तरीके से संभालना, चक्र सीमा (सीटी) सेटिंग और अन्य रोगजनक न्यूक्लिक एसिड या निष्क्रिय/अवशिष्ट SARS-CoV-2 आरएनए के साथ क्रॉस-रिएक्टिविटी आरआरटी-पीसीआर9 परख में गलत सकारात्मक परिणाम दे सकती है। इस प्रकार, यह स्पष्ट है कि पीसीआर परीक्षण वास्तव में जीन टुकड़ों के वाहक की पहचान कर सकते हैं, क्योंकि वे वास्तव में सक्रिय वायरल जीन के बीच अंतर भी नहीं कर सकते हैं, इसलिए परीक्षण केवल वाहक की पहचान कर सकते हैं, रोगियों की नहीं10। इसलिए, हमारी सेटिंग में मानक तरीकों का उपयोग करके नैदानिक प्रदर्शन का आकलन करना महत्वपूर्ण है। हालांकि इथियोपियाई सार्वजनिक स्वास्थ्य संस्थान (EPHI) और पूरे देश में कई NAAT अभिकर्मक उपलब्ध हैं, लेकिन उनकी प्रभावशीलता का कोई तुलनात्मक मूल्यांकन अभी तक रिपोर्ट नहीं किया गया है। इसलिए, इस अध्ययन का उद्देश्य नैदानिक नमूनों का उपयोग करके आरआरटी-पीसीआर द्वारा SARS-CoV-2 का पता लगाने के लिए व्यावसायिक रूप से उपलब्ध किटों के तुलनात्मक प्रदर्शन का मूल्यांकन करना था।
इस अध्ययन में कुल 164 प्रतिभागियों को शामिल किया गया था, जिनमें कोविड-19 के संदिग्ध लक्षण थे। अधिकांश नमूने उपचार केंद्रों (118/164 = 72%) से थे, जबकि शेष 46 (28%) प्रतिभागी गैर-उपचार केंद्रों से थे। केंद्र में उपचार न किए गए प्रतिभागियों में से 15 (9.1%) में चिकित्सकीय रूप से संदिग्ध मामले थे और 31 (18.9%) पुष्टि किए गए मामलों के संपर्क में थे। 93 (56.7%) प्रतिभागी पुरुष थे, और प्रतिभागियों की औसत (± SD) आयु 31.10 (± 11.82) वर्ष थी।
इस अध्ययन में, COVID-19 के लिए चार परीक्षणों की सकारात्मक और नकारात्मक दरें निर्धारित की गईं। इस प्रकार, एबॉट SARS-CoV-2 परख, दान जीन 2019-nCoV परख, SARS-CoV-2 BGI परख और सैनसुरे बायोटेक 2019-nCoV परख की सकारात्मक दरें क्रमशः 59.1%, 58.5%, 57.9% और 55.5% थीं। सकारात्मक और नकारात्मक समग्र संदर्भ मानक (CRS) स्कोर क्रमशः 97 (59.1%) और 67 (40.9%) थे (तालिका 1)। इस अध्ययन में, CRS की परिभाषा "कोई भी सकारात्मक" नियम पर आधारित थी, जिसके अनुसार चार परीक्षण परिणामों में से, दो या अधिक परीक्षण परिणाम जो समान परिणाम देते थे, उन्हें सही सकारात्मक या नकारात्मक माना जाता था।
इस अध्ययन में, हमने CRS की तुलना में सभी विश्लेषणों के लिए 100% (95% CI 94.6-100) का नकारात्मक प्रतिशत समझौता (NPA) पाया। सैनसुरे बायोटेक्नोलॉजी विश्लेषण ने 93.8% (95% CI 87.2-97.1) का न्यूनतम PPA दिखाया और दान जीन 2019-nCoV विश्लेषण में 99.4% (95% CI 96.6-99.9) का समग्र समझौता था। इसके विपरीत, SARS-CoV-2 BGI परख और सैनसुरे बायोटेक 2019-nCoV परख के बीच कुल समझौता क्रमशः 98.8% और 96.3% था (तालिका 2)।
CRS और एबॉट SARS-CoV-2 परख परिणामों के बीच कोहेन का कप्पा गुणांक पूरी तरह से सुसंगत था (K = 1.00)। इसी तरह, डैन जीन 2019-nCoV, SARS-CoV-2 BGI और सैनसुरे बायोटेक 2019-nCoV द्वारा पता लगाए गए कोहेन के कप्पा मान भी CRS (K ≥ 0.925) के साथ पूरी तरह से सुसंगत हैं। इस तुलनात्मक विश्लेषण में, काई-स्क्वायर टेस्ट (मैकनेमर टेस्ट) ने दिखाया कि सैनसुरे बायोटेक 2019-nCoV परख परिणाम CRS परिणामों (p = 0.031) (तालिका 2) से काफी अलग थे।
जैसा कि चित्र में दिखाया गया है।1 एबॉट SARS-CoV-2 परख (संयुक्त RdRp और N जीन) के न्यूनतम Ct मान (< 20 Ct) का प्रतिशत 87.6% था और सैनसुरे बायोटेक 2019-nCoV परख के ORF1a/b जीन Ct मान से पता चला कि निम्न Ct मान (< 20 Ct) का प्रतिशत 50.3% था और उच्च Ct मान (36-40 Ct) 3.2% था। 1 एबॉट SARS-CoV-2 परख (संयुक्त RdRp और N जीन) के न्यूनतम Ct मान (< 20 Ct) का प्रतिशत 87.6% था और सैनसुरे बायोटेक 2019-nCoV परख के ORF1a/b जीन Ct मान से पता चला कि निम्न Ct मान (< 20 Ct) का प्रतिशत 50.3% था और उच्च Ct मान (36-40 Ct) 3.2% था।जैसा कि चित्र में दिखाया गया है।1. आरडीआरपी और एन) कोस्ट 87,6%, और सीटी स्कैन ओआरएफ1ए/बी और सैन्स्योर बायोटेक 2019-एनसीओवी показало что процент низкого значения Ct (<20 Ct) составлял 50,3%, а высокое अतिरिक्त सीटी (36-40 सीटी) लागत 3.2%। 1, एबॉट SARS-CoV-2 (संयुक्त जीन RdRp और N) के न्यूनतम Ct मान (< 20 Ct) विश्लेषण का प्रतिशत 87.6% था, और सैनसुरे बायोटेक 2019-nCoV के ORF1a/b जीन विश्लेषण के Ct मान से पता चला कि निम्न Ct मान (< 20 Ct) का प्रतिशत 50.3% था, और उच्च मान Ct (36-40 Ct) का प्रतिशत 3.2% था।如图1 所示, Abbott SARS-CoV-2 检测(结合RdRp 和N 基因)的最低Ct 值百分比(< 20 Ct)为87.6%, Sansure Biotech 2019-एनसीओवी संक्रमण ओआरएफ1ए/बी सीटी 20 सीटी 20 सीटी (<20 सीटी) 50.3% 50.3%, 2 सीटी 36-40 सीटी आय का प्रतिशत 3.2% है। जैसा कि चित्र 1 में दिखाया गया है, एबॉट SARS-CoV-2 परीक्षण (RdRp और N जीन का संयोजन) का न्यूनतम Ct मान प्रतिशत (< 20 Ct) 87.6% है, सैनसुरे बायोटेक 2019-nCoV परीक्षण का ORF1a/b जीन Ct मान कम Ct मान (< 20 Ct) का प्रतिशत 50.3% है, उच्च Ct मान (36–40 Ct) का प्रतिशत 3.2% है। Как показано на рисунке 1, анализ Abbott SARS-CoV-2 (сочетающий гены RdRp и N) имел самое कम से कम 20 सीटी (<20 सीटी) से 87,6% अधिक, एक अतिरिक्त सीटी гена ORF1a/b в исследовании Sansure Biotech 2019- Анализ nCoV показал низкий Ct. जैसा कि चित्र 1 में दिखाया गया है, एबॉट SARS-CoV-2 परख (RdRp और N जीन को मिलाकर) में सबसे कम प्रतिशत Ct मान (< 20 Ct) 87.6% था, जबकि सैनसुरे बायोटेक 2019 अध्ययन में ORF1a/b जीन का Ct मान - nCoV के विश्लेषण ने कम Ct दिखाया। Процент значений (<20 Ct) составил 50,3%, а процент высоких значений Ct (36–40 Ct) लागत 3,2%। मानों का प्रतिशत (< 20 सीटी) 50.3% था, और उच्च सीटी मानों का प्रतिशत (36-40 सीटी) 3.2% था।एबॉट SARS-CoV-2 B परीक्षण में Ct मान 30 से ऊपर दर्ज किया गया। दूसरी ओर, बीजीआई SARS-CoV-2 परख में ORF1a/b जीन का सीटी मान उच्च था (> 36 सीटी) प्रतिशत 4% था (चित्र 1)। दूसरी ओर, बीजीआई SARS-CoV-2 परख में ORF1a/b जीन का सीटी मान उच्च था (> 36 सीटी) प्रतिशत 4% था (चित्र 1)। С ругой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 ген ORF1a/b имел высокое значение Ct (> 36 Ct), процент которого составлял 4% (рис. 1). दूसरी ओर, बीजीआई SARS-CoV-2 जीन के विश्लेषण में ORF1a/b का सीटी मान उच्च (> 36 सीटी) था, जिसका प्रतिशत 4% था (चित्र 1)।एक ही समय में BGI SARS-CoV-2, ORF1a/b, 36 Ct, 4%, ORF1a/b हो सकता है। दूसरी ओर, बीजीआई सार्स-सीओवी-2 का पता लगाने में, उच्च सीटी मान (> 36 सीटी) वाले ओआरएफ1ए/बी जीन का प्रतिशत 4% है (चित्र 1)। С другой стороны, в анализе BGI SARS-CoV-2 процент генов ORF1a/b с высокими अधिकतम सीटी (>36 सीटी) लागत 4% (रु. 1). दूसरी ओर, बीजीआई SARS-CoV-2 विश्लेषण में, उच्च सीटी मान (> 36 सीटी) वाले ओआरएफ 1 ए / बी जीन का प्रतिशत 4% था (चित्र 1)।
इस अध्ययन में, हमने 164 नासोफेरींजल नमूने लिए। सभी प्रकार के परीक्षणों के लिए, संबंधित निर्माताओं द्वारा सुझाए गए तरीकों और किटों का उपयोग करके आरएनए अलगाव और प्रवर्धन किया गया।
इस अध्ययन ने प्रदर्शित किया कि SARS-CoV-2 के लिए एबट का परीक्षण CRS के समान ही पहचान प्रदर्शन करता है, जिसमें 100% सकारात्मक, नकारात्मक और समग्र सहमति है। कोहेन का कप्पा समझौता 1.00 है, जो CRS के साथ पूर्ण सहमति दर्शाता है। अमेरिका में वाशिंगटन विश्वविद्यालय द्वारा किए गए एक समान अध्ययन में पाया गया कि CDC के प्रयोगशाला-निर्धारित परख (LDA) की तुलना में SARS-CoV-2 के लिए एबट परीक्षण की समग्र संवेदनशीलता और विशिष्टता क्रमशः 93% और 100% थी। 11. एबट SARS-CoV-2 पहचान प्रणाली N और RdRp जीनों की एक साथ संयुक्त पहचान पर आधारित है, क्योंकि दोनों जीन अधिक संवेदनशील हैं, जिससे गलत नकारात्मकता कम होती है12। ऑस्ट्रिया के वियना में एक अध्ययन से यह भी पता चला है कि बड़े निष्कर्षण नमूना वॉल्यूम और डिटेक्शन एल्यूएंट वॉल्यूम इस प्रकार, SARS-CoV-2 परख के लिए एबॉट का सही मिलान एक प्लेटफ़ॉर्म डिटेक्शन सिस्टम से जुड़ा हो सकता है जो एक साथ कॉम्बिनेटरियल जीन का पता लगाता है, बड़ी संख्या में नमूने (0.5 मिली) निकालता है, और बड़ी मात्रा में एलुएंट (40 µl) का उपयोग करता है।
हमारे परिणामों ने यह भी दिखाया कि दान आनुवंशिक परीक्षण का पता लगाने का प्रदर्शन लगभग CRS के समान ही था। यह चीन के हुआनान में अनहुई विश्वविद्यालय में किए गए एक अध्ययन14 और निर्माता के 100% सकारात्मक समझौते के दावे के अनुरूप है। लगातार परिणामों की रिपोर्ट के बावजूद, एक नमूना उसी एलुएट को फिर से जांचने के बाद गलत नकारात्मक था, लेकिन एबॉट SARS-CoV-2 और सैनसुरे बायोटेक nCoV-2019 परख में सकारात्मक था। इससे पता चलता है कि विभिन्न प्रकार के परख में परिणामों में भिन्नता हो सकती है। फिर भी, चीन में किए गए अध्ययन में, डान जीन परख का परिणाम उनके प्रयोगशाला-परिभाषित संदर्भ परख की तुलना में काफी भिन्न था (पी < 0.05)। फिर भी, चीन में किए गए अध्ययन में, डान जीन परख का परिणाम उनके प्रयोगशाला-परिभाषित संदर्भ परख की तुलना में काफी भिन्न था (पी < 0.05)। Тем не менее, в исследовании, проведенном в Китае15, результат анализа Daan Gene значительно отличался (p < 0,05) от их лабораторного эталонного विश्लेषण. हालाँकि, चीन15 में किए गए एक अध्ययन में, डान जीन का विश्लेषण परिणाम उनके प्रयोगशाला संदर्भ विश्लेषण से काफी भिन्न था (p < 0.05)।अधिक पढ़ें结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差异(p <0.05)。然而,在中国进行的研究中中15,大安基因检测的结果与其实验室定义的参考检测相比有显着差<0.05 Однако в исследовании, проведенном в Китае15, результаты генетического теста Dan значительно отличались (p < 0,05) по сравнению с его इटैलालोनोनिज़्म लैब्नोरोरोटोरोप्नीज़। हालाँकि, चीन में किए गए एक अध्ययन15 में, डान के आनुवंशिक परीक्षण के परिणाम उसके संदर्भ प्रयोगशाला परीक्षण की तुलना में काफी भिन्न थे (p < 0.05)।यह विसंगति SARS-CoV-2 का पता लगाने के लिए संदर्भ परीक्षण की संवेदनशीलता के कारण हो सकती है, और इसका कारण निर्धारित करने के लिए आगे के अध्ययन महत्वपूर्ण हो सकते हैं।
इसके अलावा, हमारे अध्ययन ने सीआरएस के साथ सार्स-सीओवी-2 बीजीआई परख के तुलनात्मक प्रदर्शन का मूल्यांकन किया, जिसमें उत्कृष्ट सकारात्मक प्रतिशत समझौता (पीपीए = 97.9%), नकारात्मक प्रतिशत समझौता (एनपीए = 100%), और लिंग के आधार पर समग्र प्रतिशत समझौता (ओपीए) दिखाया गया। = 98.8%)। कोहेन के कप्पा मूल्यों ने अच्छा समझौता दिखाया (के = 0.975)। नीदरलैंड16 और चीन15 में किए गए अध्ययनों ने सुसंगत परिणाम दिखाए हैं। SARS-CoV-2 BGI परीक्षण 10 µl प्रवर्धन/पहचान एलुएट का उपयोग करके एकल जीन (ORF1a/b) पहचान परीक्षण है। हमारे संदर्भ परिणामों के साथ अच्छे सांख्यिकीय समझौते के बावजूद, विश्लेषण में कुल नमूने के दो सकारात्मक नमूने (1.22%) छूट गए। इससे रोगी और समुदाय दोनों स्तरों पर संचरण की गतिशीलता पर बहुत बड़े नैदानिक प्रभाव पड़ सकते हैं।
इस अध्ययन में शामिल एक अन्य तुलनात्मक विश्लेषण सैनसुरे बायोटेक nCoV-2019 rRT-PCR (RUO) परख था; कुल मिलान प्रतिशत 96.3% था। सहमति की ताकत कोहेन के कप्पा मूल्य द्वारा भी निर्धारित की गई थी, जो 0.925 थी, जो सीआरएस के साथ पूर्ण सहमति को दर्शाता है। फिर से, हमारे परिणाम चीन के चांग्शा में सेंट्रल साउथ यूनिवर्सिटी और चीन के लिउझोउ शहर के लिउझोउ पीपुल्स हॉस्पिटल के क्लिनिकल प्रयोगशाला विभाग में किए गए अध्ययनों के समान हैं17। यद्यपि उपरोक्त अच्छी सांख्यिकीय सुसंगतता दर्ज की गई थी, फिर भी काई-स्क्वायर परीक्षण (मैकनेमर परीक्षण) से पता चला कि सैनसुरे बायोटेक परख के परिणाम में सीआरएस (पी < 0.005) की तुलना में सांख्यिकीय रूप से महत्वपूर्ण अंतर था। यद्यपि उपरोक्त अच्छी सांख्यिकीय सुसंगतता दर्ज की गई थी, फिर भी काई-स्क्वायर परीक्षण (मैकनेमर परीक्षण) से पता चला कि सैनसुरे बायोटेक परख के परिणाम में सीआरएस (पी < 0.005) की तुलना में सांख्यिकीय रूप से महत्वपूर्ण अंतर था। इससे पहले कि आप इसे वापस कर लें статистическое соответствие, критерий хи-квадрат (критерий माकनेमारा) प्रश्नोत्तरी, यह क्या है различие по сравнению с CRS (p < 0,005). यद्यपि उपरोक्त अच्छी सांख्यिकीय सहमति दर्ज की गई थी, लेकिन काई-स्क्वायर परीक्षण (मैकनेमर परीक्षण) से पता चला कि सैनसुरे बायोटेक परख के परिणाम में सीआरएस (पी < 0.005) की तुलना में सांख्यिकीय रूप से महत्वपूर्ण अंतर था।अधिक पढ़ें अधिकतम मूल्य सीमा (p < 0.005)尽管 记录 了上述 良好 统计 一致性 , 但 检验 ((macnemar 检验 表明 , , sansure बायोटेक 检测 结果与 crs 相比 具有 显着 ((p <0.005。。。。。。。。。。。。。。。。。。。))))) Несмотря на отмеченное выше хорошее статистическое соответствие, критерий хи-квадраt значимую разницу (p <0,005) между анализом Sansure Biotech और CRS। ऊपर उल्लिखित अच्छे सांख्यिकीय समझौते के बावजूद, काई-स्क्वायर परीक्षण (मैकनेमर परीक्षण) ने सैनसुरे बायोटेक परख और सीआरएस के बीच सांख्यिकीय रूप से महत्वपूर्ण अंतर (पी < 0.005) दिखाया।सीआरएस (पूरक तालिका 1) की तुलना में छह नमूने (3.66%) गलत नकारात्मक पाए गए; यह बहुत महत्वपूर्ण है, खासकर वायरस के संचरण की गतिशीलता को देखते हुए। उपरोक्त डेटा भी इस कम पहचान दर का समर्थन करता है15।
इस अध्ययन में, प्रत्येक परख और संबंधित प्लेटफ़ॉर्म के लिए सीटी मान निर्धारित किए गए थे, जिसमें एबॉट SARS-CoV-2 परख में सबसे कम औसत सीटी मान की सूचना दी गई थी। यह परिणाम SARS-CoV-2 का पता लगाने के लिए एबॉट की एक साथ संयुक्त आनुवंशिक परीक्षण प्रणाली से संबंधित हो सकता है। इसलिए, चित्र 1 के अनुसार, एबॉट SARS-CoV-2 के 87.6% परिणामों में सीटी मान 20 से कम थे। केवल कुछ ही नमूना परिणाम (12.4%) 20-30 रेंज में थे। 30 से ऊपर के सीटी मान दर्ज नहीं किए गए थे। एबॉट के SARS-CoV-2 पैनल आनुवंशिक परीक्षण प्रारूप के उपयोग के अलावा, यह परिणाम निचली पहचान सीमा (32.5 आरएनए प्रतियां/एमएल)18 से संबंधित हो सकता है
इस अध्ययन की कुछ सीमाएँ हैं: सबसे पहले, संसाधनों की कमी के कारण हमारे पास मानक/संदर्भ विधियाँ [जैसे वायरल लोड या अन्य प्रयोगशाला परीक्षण (LDA)] नहीं हैं। दूसरे, इस अध्ययन में इस्तेमाल किए गए सभी नमूने नासॉफिरिन्जियल स्वैब थे, जबकि परिणाम अन्य नमूना प्रकारों पर लागू नहीं थे, और तीसरे, हमारे नमूने का आकार छोटा था।
इस अध्ययन में नासॉफिरिन्जियल नमूनों का उपयोग करके SARS-CoV-2 के लिए चार rRT-PCR परीक्षणों के प्रदर्शन की तुलना की गई। सैनसुरे बायोटेक परीक्षण को छोड़कर सभी जांच परीक्षणों का प्रदर्शन लगभग तुलनीय था। इसके अलावा, सीआरएस (पी < 0.05) की तुलना में सैनसुरे बायोटेक परख में कम सकारात्मकता दर की पहचान की गई। इसके अलावा, सीआरएस (पी < 0.05) की तुलना में सैनसुरे बायोटेक परख में कम सकारात्मकता दर की पहचान की गई। Кроме того, в тесте Sansure Biotech был выявлен низкий процент положительных результатов по сравнению с CRS (p < 0,05). इसके अलावा, सैनसुरे बायोटेक परीक्षण ने सीआरएस (पी < 0.05) की तुलना में सकारात्मक परिणामों का कम प्रतिशत दिखाया।अगला, सीआरएस स्रोत, सैन्स्योर बायोटेक डेटा स्रोत (पी <0.05)。अगला, सीआरएस स्रोत, सैन्स्योर बायोटेक डेटा स्रोत (पी <0.05)。 क्रोम उत्पाद, एनाल्ज सैन्स्योर बायोटेक मोबाइल फोन के लिए कोई उपकरण नहीं результатов по сравнению с CRS (p < 0,05). इसके अलावा, सैनसुरे बायोटेक परख की सकारात्मकता दर CRS की तुलना में कम थी (p < 0.05)।पीपीए, एनपीए और समग्र सहमति का सैनसुरे बायोटेक एनसीओवी-2019 (आरयूओ) विश्लेषण 0.925 के कोहेन कप्पा समझौते के मूल्य के साथ 93.5% से अधिक हो गया। अंत में, सैनसुरे बायोटेक परख (आरयूओ) को इथियोपिया में उपयोग के लिए और अधिक सत्यापन की आवश्यकता है, और व्यक्तिगत निर्माताओं के दावों का मूल्यांकन करने के लिए अतिरिक्त शोध पर विचार किया जाना चाहिए।
तुलनात्मक अध्ययन डिजाइन अदीस अबाबा, एका कोटेबे अस्पताल, मिलेनियम चर्च ट्रीटमेंट सेंटर, ज़्यूडिटू मेमोरियल अस्पताल और सेंट पीटर के तपेदिक विशेषज्ञ अस्पताल में चार स्वास्थ्य सुविधाओं में आयोजित किया गया था। डेटा 1 दिसंबर से 31 दिसंबर, 2020 के बीच एकत्र किया गया था। इस अध्ययन के लिए चिकित्सा सुविधाओं को उद्देश्यपूर्ण रूप से उनके मामलों की उच्च संख्या और शहर में प्रमुख उपचार केंद्रों की उपलब्धता के आधार पर चुना गया था। इसी तरह, एबीआई 7500 और एबॉट m2000 रियल-टाइम पीसीआर उपकरणों सहित उपकरणों को एनएएटी अभिकर्मक निर्माताओं की सिफारिशों के अनुसार चुना गया था और इस अध्ययन के लिए चार पीसीआर डिटेक्शन किट का चयन किया गया था, क्योंकि इथियोपिया में अधिकांश प्रयोगशालाओं ने कम से कम चार का इस्तेमाल किया था।
EPHI को भेजे गए COVID-19 के लिए जांच के तहत व्यक्तियों से वायरल ट्रांसपोर्ट मीडियम (VTM) (मिराक्लीन टेक्नोलॉजी, शेन्ज़ेन, चीन) के 3 मिली का उपयोग करके 1 से 30 दिसंबर 2020 तक SARS-CoV-2 के लिए परीक्षण किया गया था। प्रशिक्षित नमूना संग्रहकर्ताओं द्वारा नासोफेरींजल नमूने एकत्र किए गए और ट्रिपल पैक में EPHI को भेजे गए। न्यूक्लिक एसिड अलगाव से पहले, प्रत्येक नमूने को एक विशिष्ट पहचान संख्या सौंपी जाती है। मैन्युअल और स्वचालित निष्कर्षण विधियों का उपयोग करके आगमन के तुरंत बाद प्रत्येक नमूने से निष्कर्षण किया जाता है। इस प्रकार, एबॉट m2000 के स्वचालित निष्कर्षण के लिए, प्रत्येक नमूने से 1.3 मिली (0.8 मिली डेड वॉल्यूम और 0.5 मिली एक्सट्रैक्शन इनलेट वॉल्यूम सहित) ) 96 [92 नमूने, दो पहचान नियंत्रण और दो गैर-टेम्पलेट नियंत्रण (एनटीसी)] के बैच को वास्तविक समय में SARS-CoV-2 (EUA) के दो दौर की समग्र प्रक्रिया (पुनर्प्राप्ति और पता लगाने) में शामिल किया गया था। खनन। इसी तरह, मैनुअल निष्कर्षण के लिए, समान नमूनों (स्वचालित निष्कर्षण और खोज के लिए) का उपयोग करें। इस प्रकार, पूरी प्रक्रिया के दौरान, 140 µl नमूनों को नौ दौर में 24 (20 नमूने, दो परख नियंत्रण और दो NTC सहित) के बैचों में QIAamp वायरल RNA मिनी किट (QIAGEN GmbH, हिल्डेन, जर्मनी) का उपयोग करके अलग किया गया और निकाला गया। SARS-CoV-2 BGI परख, डान जीन परख और सैनसुरे बायोटेक परख का उपयोग करके ABI 7500 थर्मल साइक्लर का उपयोग करके मैन्युअल रूप से निकाले गए एलुएट को बढ़ाया गया और पता लगाया गया।
SARS-CoV-2 वायरल RNA का स्वचालित पृथक्करण और शुद्धिकरण एबट DNA नमूना तैयारी अभिकर्मकों का उपयोग करके चुंबकीय मनका सिद्धांत का पालन करता है। नमूनों का निष्क्रियकरण और वायरल कणों का घुलनशीलता प्रोटीन को विकृत करने और RNase को निष्क्रिय करने के लिए ग्वानिडीन आइसोथियोसाइनेट युक्त डिटर्जेंट का उपयोग करके किया जाता है। फिर RNA को सिलिका का उपयोग करके ठोस चरण पृथक्करण द्वारा प्रोटीन से अलग किया जाता है, यानी ग्वानिडीनियम नमक और लाइसिस बफर का क्षारीय pH सिलिका (SiO2) से न्यूक्लिक एसिड के बंधन को बढ़ावा देता है। धोने का चरण एक स्पष्ट घोल बनाने के लिए शेष प्रोटीन और मलबे को हटा देता है। पारदर्शी RNA को उपकरण के चुंबकीय क्षेत्र20,21 का उपयोग करके सिलिका-आधारित माइक्रोपार्टिकल्स से अलग किया जाता है। दूसरी ओर, चुंबकीय स्टैंड के बजाय सेंट्रीफ्यूजेशन का उपयोग करके स्पिन कॉलम विधि द्वारा RNA का मैन्युअल पृथक्करण और माइक्रोपार्टिकल्स को एलुएंट से अलग किया जाता है।
एबॉट रियल-टाइम SARS-CoV-2 डिटेक्शन टेस्ट (एबॉट मॉलिक्यूलर, इंक.) निर्माता के निर्देशों के अनुसार किया गया था, जिसे WHO और FDA से EUA19,22 प्राप्त हुआ था। इस प्रोटोकॉल में, निष्कर्षण से पहले नमूना निष्क्रियता 30 मिनट के लिए 56 °C पर पानी के स्नान में की गई थी। वायरस निष्क्रियता के बाद, एबॉट m2000 डीएनए नमूना तैयारी प्रणाली का उपयोग करके 0.5 मिली वीटीएम से एबॉट m2000 एसपी उपकरण पर न्यूक्लिक एसिड निष्कर्षण किया गया था। निर्माता के अनुसार। एबॉट m2000 आरटी-पीसीआर उपकरण का उपयोग करके प्रवर्धन और पता लगाने का प्रदर्शन किया गया, और आरडीआरपी और एन जीन के लिए दोहरी पहचान की गई
इस किट की प्रवर्धन पहचान विधि एक-चरणीय आरटी-पीसीआर तकनीक पर आधारित है। लक्ष्य क्षेत्र प्रवर्धन का पता लगाने के लिए दान जीन प्रौद्योगिकी द्वारा संरक्षित क्षेत्रों के रूप में ORF1a/b और N जीन का चयन किया गया था। नमूनों में SARS-CoV-2 RNA का पता लगाने के लिए विशिष्ट प्राइमर और फ्लोरोसेंट जांच (FAM के साथ लेबल किए गए N जीन जांच, VIC के साथ लेबल किए गए ORF1a/b जांच) डिज़ाइन किए गए हैं। अंतिम एलुएंट और मास्टर मिक्स 25 µl की अंतिम मात्रा में मास्टर मिक्स के 20 µl में 5 µl एलुएंट मिलाकर तैयार किए गए थे। ABI 750024 रियल-टाइम पीसीआर उपकरण पर प्रवर्धन और पता लगाने का काम एक साथ किया गया।
ORF1a/b और N जीन का पता Sansure Biotech nCoV-2019 न्यूक्लिक एसिड डायग्नोस्टिक किट (फ्लोरोसेंट PCR डिटेक्शन) का उपयोग करके लगाया गया। ORF1a/b क्षेत्र के लिए FAM चैनल और N जीन के लिए ROX चैनल का चयन करके प्रत्येक लक्ष्य जीन के लिए विशिष्ट जांच तैयार करें। इस परख किट में, एलुएंट और मास्टर मिक्स अभिकर्मकों को इस प्रकार जोड़ा जाता है: पता लगाने/प्रवर्धन के लिए 30 µl मास्टर मिक्स अभिकर्मक और 20 µl एल्यूटेड नमूना तैयार करें। प्रवर्धन/पहचान के लिए रियल-टाइम PCR ABI 750025 का उपयोग किया गया।
SARS-CoV-2 BGI परीक्षण COVID-19 के निदान के लिए एक फ्लोरोसेंट रियल-टाइम rRT-PCR किट है। लक्ष्य क्षेत्र SARS-CoV-2 जीनोम के ORF1a/b क्षेत्र में स्थित है, जो एक एकल जीन पहचान विधि है। इसके अलावा, मानव हाउसकीपिंग जीन β-actin एक आंतरिक रूप से विनियमित लक्ष्य जीन है। मास्टर मिक्स अभिकर्मक के 20 µl और निकाले गए RNA नमूने के 10 µl को एक वेल प्लेट26 में मिलाकर मास्टर मिक्स तैयार किया जाता है। प्रवर्धन और पता लगाने के लिए ABI 7500 फ्लोरोसेंट क्वांटिटेटिव रियल-टाइम PCR उपकरण का उपयोग किया गया था। सभी न्यूक्लिक एसिड प्रवर्धन, प्रत्येक परख के लिए PCR रन की स्थिति और परिणामों की व्याख्या संबंधित निर्माता के निर्देशों (तालिका 3) के अनुसार की गई थी।
इस तुलनात्मक विश्लेषण में, हमने चार विश्लेषणों के लिए प्रतिशत समझौते (सकारात्मक, नकारात्मक और समग्र) और अन्य तुलना मापदंडों को निर्धारित करने के लिए संदर्भ मानक विधि का उपयोग नहीं किया। प्रत्येक परीक्षण तुलना सीआरएस के साथ की गई थी, इस अध्ययन में सीआरएस को नियम "किसी भी सकारात्मक" द्वारा निर्धारित किया गया था और परिणाम निर्धारित किया गया था, एक एकल परीक्षण से नहीं, हमने कम से कम दो मिलान किए गए परीक्षण परिणामों का उपयोग किया। इसके अलावा, COVID-19 संचरण के मामले में, झूठे नकारात्मक परिणाम झूठे सकारात्मक परिणामों से अधिक खतरनाक हैं। इसलिए, CRS परिणाम से यथासंभव सटीक रूप से "सकारात्मक" कहने के लिए, कम से कम दो परख परीक्षण सकारात्मक होने चाहिए, जिसका अर्थ है कि कम से कम एक सकारात्मक परिणाम EUA परख से आने की संभावना है। इस प्रकार, चार परीक्षण परिणामों में से, दो या अधिक परीक्षण परिणाम जो समान परिणाम देते हैं उन्हें सही सकारात्मक या नकारात्मक माना जाता है18,27।
डेटा को संरचित डेटा निष्कर्षण फ़ॉर्म का उपयोग करके एकत्र किया गया था, डेटा प्रविष्टि और विश्लेषण एक्सेल सांख्यिकीय सॉफ़्टवेयर और वर्णनात्मक सांख्यिकी के लिए SPSS संस्करण 23.0 का उपयोग करके किया गया था। सकारात्मक, नकारात्मक और समग्र प्रतिशत सहमति का विश्लेषण किया गया, और CRS के साथ प्रत्येक विधि की सहमति की डिग्री निर्धारित करने के लिए एक कप्पा स्कोर का उपयोग किया गया। कप्पा मानों की व्याख्या इस प्रकार की जाती है: हल्की सहमति के लिए 0.01 से 0.20, सामान्य सहमति के लिए 0.21 से 0.40, मध्यम सहमति के लिए 0.41-0.60, प्रमुख सहमति के लिए 0.61-0.80 और पूर्ण सहमति के लिए 0.81-0.9928।
अदीस अबाबा विश्वविद्यालय से नैतिक मंजूरी प्राप्त की गई थी और इस अध्ययन के लिए सभी प्रायोगिक प्रोटोकॉल इथियोपियाई सार्वजनिक स्वास्थ्य संस्थान के वैज्ञानिक नैतिकता समीक्षा बोर्ड द्वारा अनुमोदित किए गए थे। EPHI नैतिकता लाइसेंस के लिए संदर्भ संख्या EPHI/IRB-279-2020 है। सभी विधियों को COVID-19 के उपचार के लिए इथियोपियाई राष्ट्रीय व्यापक दिशानिर्देशों की सिफारिशों और प्रावधानों के अनुसार लागू किया गया था। इसके अलावा, अध्ययन में भाग लेने से पहले सभी अध्ययन प्रतिभागियों से लिखित सूचित सहमति प्राप्त की गई थी।
इस अध्ययन में प्राप्त या विश्लेषित सभी डेटा इस प्रकाशित लेख में शामिल हैं। इस अध्ययन के परिणामों का समर्थन करने वाले डेटा उचित अनुरोध पर संबंधित लेखक से उपलब्ध हैं।
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पोस्ट करने का समय: दिसम्बर-08-2022